TRPV1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRPV1, VR1, transient receptor potential cation channel subfamily V member 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602076 MGI: 1341787 HomoloGene: 12920 GeneCards: TRPV1 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
Анандамід, капсаїцин, piperine, 5S-HETE, Камфора, гідрон, capsazepine, 2-aminoethoxydiphenylborate, 5'-iodoresiniferatoxin, Аліцин, NADA, amg-517, AZD1386, SB-705498[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • ion channel activity • phosphoprotein binding • ATP binding • cation transmembrane transporter activity • cation channel activity • ligand-gated ion channel activity • calcium-release channel activity • temperature-gated ion channel activity • identical protein binding • chloride channel regulator activity • transmembrane signaling receptor activity • excitatory extracellular ligand-gated ion channel activity • calcium channel activity • extracellular ligand-gated ion channel activity • phosphatidylinositol binding • зв'язування з іоном металу • calmodulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • postsynaptic membrane • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • синапс • міжклітинні контакти • dendritic spine membrane • гіалоплазма • neuronal cell body • intrinsic component of plasma membrane • дендрит (нейробіологія) • external side of plasma membrane • neuron projection • integral component of plasma membrane • мітохондрія |
---|
Біологічний процес | • ion transport • chemosensory behavior • cell surface receptor signaling pathway • calcium ion transmembrane transport • thermoception • calcium ion transport • inflammatory response • трансмембранний транспорт • release of sequestered calcium ion into cytosol • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • diet induced thermogenesis • detection of chemical stimulus involved in sensory perception of pain • microglial cell activation • cellular response to growth factor stimulus • positive regulation of gastric acid secretion • response to peptide hormone • cellular response to nerve growth factor stimulus • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process • negative regulation of establishment of blood-brain barrier • lipid metabolism • temperature homeostasis • response to heat • cellular response to temperature stimulus • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • peptide secretion • detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain • sensory perception of mechanical stimulus • smooth muscle contraction involved in micturition • behavioral response to pain • response to pain • cellular response to alkaloid • cellular response to cytokine stimulus • fever generation • detection of temperature stimulus involved in thermoception • positive regulation of apoptotic process • urinary bladder smooth muscle contraction • glutamate secretion • sensory perception of pain • cellular response to tumor necrosis factor • cellular response to ATP • ion transmembrane transport • response to pH • response to organonitrogen compound • cellular response to heat • protein homotetramerization • excitatory postsynaptic potential • cellular response to acidic pH • response to capsazepine • calcium ion import across plasma membrane • negative regulation of systemic arterial blood pressure • negative regulation of heart rate • negative regulation of mitochondrial membrane potential |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_018727 NM_080704 NM_080705 NM_080706 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_061197 NP_542435 NP_542436 NP_542437 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 3.57 – 3.61 Mb | Хр. 11: 73.13 – 73.15 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRPV1 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1) – білок, який кодується однойменним геном TRPV1, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 839 амінокислот, а молекулярна маса — 94 956 Da[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKKWSSTDLG | | AAADPLQKDT | | CPDPLDGDPN | | SRPPPAKPQL | | STAKSRTRLF |
GKGDSEEAFP | | VDCPHEEGEL | | DSCPTITVSP | | VITIQRPGDG | | PTGARLLSQD |
SVAASTEKTL | | RLYDRRSIFE | | AVAQNNCQDL | | ESLLLFLQKS | | KKHLTDNEFK |
DPETGKTCLL | | KAMLNLHDGQ | | NTTIPLLLEI | | ARQTDSLKEL | | VNASYTDSYY |
KGQTALHIAI | | ERRNMALVTL | | LVENGADVQA | | AAHGDFFKKT | | KGRPGFYFGE |
LPLSLAACTN | | QLGIVKFLLQ | | NSWQTADISA | | RDSVGNTVLH | | ALVEVADNTA |
DNTKFVTSMY | | NEILMLGAKL | | HPTLKLEELT | | NKKGMTPLAL | | AAGTGKIGVL |
AYILQREIQE | | PECRHLSRKF | | TEWAYGPVHS | | SLYDLSCIDT | | CEKNSVLEVI |
AYSSSETPNR | | HDMLLVEPLN | | RLLQDKWDRF | | VKRIFYFNFL | | VYCLYMIIFT |
MAAYYRPVDG | | LPPFKMEKTG | | DYFRVTGEIL | | SVLGGVYFFF | | RGIQYFLQRR |
PSMKTLFVDS | | YSEMLFFLQS | | LFMLATVVLY | | FSHLKEYVAS | | MVFSLALGWT |
NMLYYTRGFQ | | QMGIYAVMIE | | KMILRDLCRF | | MFVYIVFLFG | | FSTAVVTLIE |
DGKNDSLPSE | | STSHRWRGPA | | CRPPDSSYNS | | LYSTCLELFK | | FTIGMGDLEF |
TENYDFKAVF | | IILLLAYVIL | | TYILLLNMLI | | ALMGETVNKI | | AQESKNIWKL |
QRAITILDTE | | KSFLKCMRKA | | FRSGKLLQVG | | YTPDGKDDYR | | WCFRVDEVNW |
TTWNTNVGII | | NEDPGNCEGV | | KRTLSFSLRS | | SRVSGRHWKN | | FALVPLLREA |
SARDRQSAQP | | EEVYLRQFSG | | SLKPEDAEVF | | KSPAASGEK |
TRPV1 - це неселективний катіонний канал та належить до іонних каналів, який активується:
Капсаїцин є найбільш потужним і специфічним відомим агоністом TRPV1.
Функції білка TRPV1
TRPV1 задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою кальмодуліну, іонами металів, іоном кальцію. Цей рецептор також активується підвищенням температури в шкідливому діапазоні, тож можливо, що він функціонує як перетворювач болючих теплових подразників in vivo.[6]
Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.
Експресія гена TRPV1
Цей ген має 10 транскриптів (сплайс варіантів), 197 ортологів та 5 паралогів. [7]
Експресія TRPV1, в ЦНС, має важливе значення для потенційних побічних ефектів агоністів і антагоністів TRPV1, що розробляються для лікування хронічного болю.[8]
Cavanaugh et al. (2011) [Архівовано 19 січня 2019 у Wayback Machine.] досліджували експресію TRPV1, використовуючи метод генного націлювання для модифікації генетичного локусу TRPV1. Була продемонстрована стійка експресія TRPV1 у первинних аферентних нейронах та виявлена у підмножині клітин гладких м’язів в тканинах, що виконують функцію терморегуляції.
Розлади, що пов'язані з TRPV1
Соматоформний розлад пов’язаний із тривогою та обсесивно-компульсивним розладом і має такі симптоми, як судоми, задишка та запаморочення. Важливим геном, асоційованим із соматоформним розладом, є TRPV1.[9]
- Синдром "палаючого рота"[en]
Синдром печіння рота, також відомий як стоматодинія, пов’язаний з глоситом та хворобою Graft-versus-host disease[en] , і має симптоми, включаючи пероральні прояви. Важливим геном, пов’язаним із синдромом, є TRPV1. [10]
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з TRPV1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12716 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q8NER1 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ TRPV1 Gene - GeneCards | TRPV1 Protein | TRPV1 Antibody. www.genecards.org. Архів оригіналу за 25 січня 2021. Процитовано 23 грудня 2020.
- ↑ Gene: TRPV1 (ENSG00000196689) - Summary - Homo_sapiens - Ensembl genome browser 102. www.ensembl.org. Архів оригіналу за 9 червня 2019. Процитовано 23 грудня 2020.
- ↑ Cavanaugh, Daniel J.; Chesler, Alexander T.; Jackson, Alexander C.; Sigal, Yaron M.; Yamanaka, Hiroki; Grant, Rebecca; O'Donnell, Dajan; Nicoll, Roger A.; Shah, Nirao M. (30 березня 2011). Trpv1 Reporter Mice Reveal Highly Restricted Brain Distribution and Functional Expression in Arteriolar Smooth Muscle Cells. Journal of Neuroscience (англ.). Т. 31, № 13. с. 5067—5077. doi:10.1523/JNEUROSCI.6451-10.2011. ISSN 0270-6474. PMID 21451044. Архів оригіналу за 21 червня 2021. Процитовано 23 грудня 2020.
- ↑ Somatoform Disorder disease: Malacards - Research Articles, Drugs, Genes, Clinical Trials. www.malacards.org. Архів оригіналу за 14 червня 2021. Процитовано 23 грудня 2020.
- ↑ Burning Mouth Syndrome disease: Malacards - Research Articles, Drugs, Genes, Clinical Trials. www.malacards.org. Архів оригіналу за 11 травня 2021. Процитовано 23 грудня 2020.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| |
---|
| Ліганд-залежні | |
---|
| Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
| | |
---|
| постійно відчинені | |
---|
| Протончутливі | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | K+: Калієві канали |
---|
| Кальцій-активовані | |
---|
| Вхідного випрямлення | |
---|
| Двопородоменні | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | | | |
|