TPCN1

Ідентифікатори

Символи

TPCN1, TPC1, two pore segment channel 1

Зовнішні ІД

OMIM: 609666 MGI: 2182472 HomoloGene: 9905 GeneCards: TPCN1

Реагує на сполуку

phosphatidyl (3,5) inositol biphosphate, верапаміл^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium channel activity • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • NAADP-sensitive calcium-release channel activity • voltage-gated calcium channel activity • calcium activated cation channel activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • ендосома • мембрана • клітинна мембрана • lysosomal membrane • лізосома • endosome membrane • CatSper complex
Біологічний процес	• membrane depolarization during action potential • positive regulation of autophagy • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • ion transmembrane transport • calcium ion transmembrane transport • calcium ion transport • трансмембранний транспорт • release of sequestered calcium ion into cytosol • flagellated sperm motility
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


53373


252972

Ensembl


ENSG00000186815


ENSMUSG00000032741

UniProt


Q9ULQ1


Q9EQJ0

RefSeq (мРНК)


NM_001143819 NM_001301214 NM_017901 NM_001351346 NM_001351347


NM_145853

RefSeq (білок)


NP_001137291 NP_001288143 NP_060371 NP_001338275 NP_001338276


NP_665852

Локус (UCSC)

Хр. 12: 113.22 – 113.3 Mb

Хр. 5: 120.67 – 120.73 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TPCN1 (англ. Two pore segment channel 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 816 амінокислот, а молекулярна маса — 94 147^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVSLDDDVP	LILTLDEGGS	APLAPSNGLG	QEELPSKNGG	SYAIHDSQAP
SLSSGGESSP	SSPAHNWEMN	YQEAAIYLQE	GENNDKFFTH	PKDAKALAAY
LFAHNHLFYL	MELATALLLL	LLSLCEAPAV	PALRLGIYVH	ATLELFALMV
VVFELCMKLR	WLGLHTFIRH	KRTMVKTSVL	VVQFVEAIVV	LVRQMSHVRV
TRALRCIFLV	DCRYCGGVRR	NLRQIFQSLP	PFMDILLLLL	FFMIIFAILG
FYLFSPNPSD	PYFSTLENSI	VSLFVLLTTA	NFPDVMMPSY	SRNPWSCVFF
IVYLSIELYF	IMNLLLAVVF	DTFNDIEKRK	FKSLLLHKRT	AIQHAYRLLI
SQRRPAGISY	RQFEGLMRFY	KPRMSARERY	LTFKALNQNN	TPLLSLKDFY
DIYEVAALKW	KAKKNREHWF	DELPRTALLI	FKGINILVKS	KAFQYFMYLV
VAVNGVWILV	ETFMLKGGNF	FSKHVPWSYL	VFLTIYGVEL	FLKVAGLGPV
EYLSSGWNLF	DFSVTVFAFL	GLLALALNME	PFYFIVVLRP	LQLLRLFKLK
ERYRNVLDTM	FELLPRMASL	GLTLLIFYYS	FAIVGMEFFC	GIVFPNCCNT
STVADAYRWR	NHTVGNRTVV	EEGYYYLNNF	DNILNSFVTL	FELTVVNNWY
IIMEGVTSQT	SHWSRLYFMT	FYIVTMVVMT	IIVAFILEAF	VFRMNYSRKN
QDSEVDGGIT	LEKEISKEEL	VAVLELYREA	RGASSDVTRL	LETLSQMERY
QQHSMVFLGR	RSRTKSDLSL	KMYQEEIQEW	YEEHAREQEQ	QRQLSSSAAP
AAQQPPGSRQ	RSQTVT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Two pore segment channel 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18182 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9ULQ1 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані