CACNA2D1

CACNA2D1
Ідентифікатори
Символи CACNA2D1, CACNA2, CACNL2A, CCHL2A, LINC01112, lncRNA-N3, calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1
Зовнішні ІД OMIM: 114204 MGI: 88295 HomoloGene: 579 GeneCards: CACNA2D1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, неспецифічний виразковий коліт, fatty liver disease[1]
Реагує на сполуку
bepridil hydrochloride monohydrate[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

voltage-gated calcium channel activity
зв'язування з іоном металу
voltage-gated ion channel activity
calcium channel activity
voltage-gated calcium channel activity involved in cardiac muscle cell action potential
voltage-gated calcium channel activity involved in bundle of His cell action potential

Клітинна компонента

voltage-gated calcium channel complex
L-type voltage-gated calcium channel complex
integral component of membrane
T-tubule
клітинна мембрана
екзосома
мембрана
sarcoplasmic reticulum

Біологічний процес

regulation of ion transmembrane transport
regulation of calcium ion transport
cardiac conduction
ion transport
calcium ion transmembrane transport
calcium ion transport
GO:0015915 транспорт
cardiac muscle cell action potential involved in contraction
calcium ion transport into cytosol
positive regulation of high voltage-gated calcium channel activity
regulation of heart rate by cardiac conduction
calcium ion transmembrane transport via high voltage-gated calcium channel
regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane repolarization
regulation of membrane repolarization during action potential
membrane depolarization during bundle of His cell action potential
calcium ion import across plasma membrane
regulation of calcium ion transmembrane transport via high voltage-gated calcium channel
cellular response to amyloid-beta

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
781
12293
Ensembl
ENSG00000153956
ENSMUSG00000040118
UniProt
P54289
O08532
RefSeq (мРНК)
NM_000722
NM_001302890
NM_001366867
NM_001110843
NM_001110844
NM_001110845
NM_001110846
NM_009784
RefSeq (білок)
NP_000713
NP_001289819
NP_001353796
NP_001104313
NP_001104314
NP_001104315
NP_001104316
NP_033914
Локус (UCSC) Хр. 7: 81.95 – 82.44 Mb Хр. 5: 16.14 – 16.58 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CACNA2D1 (англ. Calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 103 амінокислот, а молекулярна маса — 124 568[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAAGCLLALTLTLFQSLLIGPSSEEPFPSAVTIKSWVDKMQEDLVTLAKT
ASGVNQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSKALVRL
ALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAKDDLDPEKNDSEPGSQRIKPVFI
EDANFGRQISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDEVFKKNREED
PSLLWQVFGSATGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRRRPWYIQGAAS
PKDMLILVDVSGSVSGLTLKLIRTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQD
VSCFQHLVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGITDYKKGFSFAFEQLLNYNVS
RANCNKIIMLFTDGGEERAQEIFNKYNKDKKVRVFTFSVGQHNYDRGPIQ
WMACENKGYYYEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNVY
LDALELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLKNQLILGVMGVDVSLEDIKRL
TPRFTLCPNGYYFAIDPNGYVLLHPNLQPKPIGVGIPTINLRKRRPNIQN
PKSQEPVTLDFLDAELENDIKVEIRNKMIDGESGEKTFRTLVKSQDERYI
DKGNRTYTWTPVNGTDYSLALVLPTYSFYYIKAKLEETITQARYSETLKP
DNFEESGYTFIAPRDYCNDLKISDNNTEFLLNFNEFIDRKTPNNPSCNAD
LINRVLLDAGFTNELVQNYWSKQKNIKGVKARFVVTDGGITRVYPKEAGE
NWQENPETYEDSFYKRSLDNDNYVFTAPYFNKSGPGAYESGIMVSKAVEI
YIQGKLLKPAVVGIKIDVNSWIENFTKTSIRDPCAGPVCDCKRNSDVMDC
VILDDGGFLLMANHDDYTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYAFNKSYDY
QSVCEPGAAPKQGAGHRSAYVPSVADILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLT
FPRLLEAVEMEDDDFTASLSKQSCITEQTQYFFDNDSKSFSGVLDCGNCS
RIFHGEKLMNTNLIFIMVESKGTCPCDTRLLIQAEQTSDGPNPCDMVKQP
RYRKGPDVCFDNNVLEDYTDCGGVSGLNPSLWYIIGIQFLLLWLVSGSTH
RLL

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з CACNA2D1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1399 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
  6. UniProt, P54289 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 7
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
 
Ліганд-залежні
Потенціалкеровані
  • L-тип/Cavα
  • N-тип/Cavα2.2
  • P-тип/Cavα
  • Q-тип/Cavα2.1
  • R-тип/Cavα2.3
  • T-тип/Cavα
 
постійно відчинені
Протончутливі
  • Кислота
Потенціалкеровані
 
K+: Калієві канали
Кальцій-активовані
Вхідного випрямлення
Двопородоменні
Потенціалкеровані
 
Різні
Cl: Хлорні канали
H+: Протонні канали
M+: CNG-канали
M+: TRP-канали
H2O (+ розчини): Порини
Цитоплазма: Щілинні контакти
 
За механізмом залежності
Ion channel class