麻雀冠狀病毒HKU17

麻雀冠狀病毒HKU17
病毒分類 编辑
(未分级) 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
门: 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲: 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目: 套式病毒目 Nidovirales
科: 冠状病毒科 Coronaviridae
属: 丁型冠狀病毒屬 Deltacoronavirus
种:
麻雀冠狀病毒HKU17 SpCoV HKU17

麻雀冠狀病毒HKU17(sparrow coronavirus HKU17、SpCoV HKU17)是丁型冠狀病毒屬的一種病毒,在香港麻雀身上發現,於2012年由香港大學研究團隊發表。此病毒與豬丁型冠狀病毒(PdCV)和鵪鶉冠狀病毒HKU30(QuaCoV UAE-HKU30)的複製酶保守區域的胺基酸序列相似度高於90%,顯示三種病毒應為同一物種的不同亞種[1][2]

基因組

麻雀冠狀病毒HKU17的基因組約長26000nt,編碼冠狀病毒皆有的複製酶(1ab)以及刺突蛋白(S)、外膜蛋白(sM)、膜蛋白(M)與衣殼蛋白(N)等四種結構蛋白,另有6、7a、7b與7c等四個開放閱讀框編碼輔助蛋白,其基因順序為1ab-S-E-M-6-N-7a-7b-7c,其中7a位於衣殼蛋白的開放閱讀框內,7b與7c則位於其下游(即基因組的最3端)[2]

參考文獻

  1. ^ Woo, P. C. Y.; Lau, S. K. P.; Lam, C. S. F.; Lau, C. C. Y.; Tsang, A. K. L.; Lau, J. H. N.; Bai, R.; Teng, J. L. L.; Tsang, C. C. C.; Wang, M.; Zheng, B.-J.; Chan, K.-H.; Yuen, K.-Y. Discovery of Seven Novel Mammalian and Avian Coronaviruses in the Genus Deltacoronavirus Supports Bat Coronaviruses as the Gene Source of Alphacoronavirus and Betacoronavirus and Avian Coronaviruses as the Gene Source of Gammacoronavirus and Deltacoronavirus. Journal of Virology. 2012, 86 (7): 3995–4008. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.06540-11. 
  2. ^ 2.0 2.1 Lau, Susanna K. P.; Wong, Emily Y. M.; Tsang, Chi-Ching; Ahmed, Syed Shakeel; Au-Yeung, Rex K. H.; Yuen, Kwok-Yung; Wernery, Ulrich; Woo, Patrick C. Y.; Gallagher, Tom. Discovery and Sequence Analysis of Four Deltacoronaviruses from Birds in the Middle East Reveal Interspecies Jumping with Recombination as a Potential Mechanism for Avian-to-Avian and Avian-to-Mammalian Transmission. Journal of Virology. 2018, 92 (15). ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.00265-18. 
 
甲型冠狀病毒屬
(α-CoV)
甲型冠狀病毒1型
甲型冠狀病毒2型
雪貂冠狀病毒(FRECV · FRSCV) · 水鼬冠狀病毒(MCoV)
229E病毒
人類冠狀病毒229E(HCoV-229E) · 羊駝冠狀病毒(ACoV) · 單峰駱駝229E樣冠狀病毒 · 蝙蝠229E樣冠狀病毒
NL63病毒
人類冠狀病毒NL63(HCoV-NL63) · NL63相關蝙蝠冠狀病毒英语NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b
長翼蝠冠狀病毒HKU8(Bat-CoV HKU8) · 長翼蝠冠狀病毒1型(Bat-CoV 1A/1B) · 褐扁顱蝠冠狀病毒HKU33(Tr-BatCoV HKU33)
蝙蝠冠狀病毒HKU10(Bat-CoV HKU10) · 马铁菊头蝠甲型冠状病毒HuB-2013英语Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013 · 中華菊頭蝠冠狀病毒HKU32(Rs-BatCoV HKU32) · 蝙蝠冠狀病毒CDPHE15(BatCoV CDPHE15) · 高頭蝠冠狀病毒512(Sc-BatCoV-512) · 猪流行性腹泻病毒(PEDV)
其他
鼩鼱冠狀病毒T14(Sa-CoV T14) · 文成鼩鼱病毒(WESV) · 鹿城褐家鼠冠状病毒(LRNV)
乙型冠狀病毒屬
(β-CoV)
Embecovirus英语Embecovirus
(支系A)
乙型冠狀病毒1型(β1CoV)
牛冠狀病毒(BCoV) · 人類冠狀病毒OC43(HCoV-OC43) · 馬冠狀病毒(ECoV) · 豬凝血性腦脊髓炎病毒(PHEV) · 犬呼吸道冠狀病毒(CRCoV)
兔冠狀病毒HKU14(RbCoV HKU14) · 黃鼠冠狀病毒HKU24(ChRCoV HKU24) · 龍泉黑線姬鼠冠狀病毒(LAMV)
鼠冠狀病毒(M-CoV)
鼠肝炎病毒(MHV) · 大鼠冠狀病毒(RCoV)(大鼠涎淚腺炎病毒SDAV · 帕克RCoV)
人類冠狀病毒HKU1(HCoV-HKU1) · 龍泉羅賽鼠冠狀病毒(LRLV)
Merbecovirus英语Merbecovirus
(支系C)
刺蝟冠狀病毒(EriCoV) · 東北刺蝟冠狀病毒HKU31(Ea-HedCoV HKU31) · 扁颅蝠冠状病毒HKU4(Bat-CoV HKU4) · 伏翼蝠冠状病毒HKU5(Bat-CoV HKU5) · 中東呼吸綜合症冠狀病毒(MERS-CoV) · 祖魯棕蝠冠狀病毒(NeoCoV) · 灰伏翼冠狀病毒HKU25(Hp-BatCoV HKU25)
Nobecovirus英语Nobecovirus(支系D)
果蝠冠状病毒GCCDC1(Ro-BatCoV GCCDC1) · 果蝠冠状病毒HKU9(Ro-BatCoV HKU9)
Hibecovirus英语Hibecovirus                            
普氏蹄蝠冠狀病毒ZJ013(BtHp-BetaCoV/ZJ2013)
Sarbecovirus(支系B)                            
SARS-CoV-1 · SARS-CoV-2 · 变种 · 蝙蝠SARSr-CoV(詳见Template:SARSr-CoV)
丙型冠状病毒属
(γ-CoV)
Cegacovirus
鯨豚冠狀病毒(白鯨冠狀病毒SW1 · 瓶鼻海豚冠狀病毒HKU22)
Brangacovirus英语Brangacovirus
Igacovirus英语Igacovirus
禽冠狀病毒(傳染性支氣管炎病毒) · 禽冠狀病毒9203(火雞冠狀病毒)
丁型冠狀病毒屬
(δ-CoV)
鵯冠狀病毒HKU11(BuCoV HKU11) · 鶇冠狀病毒HKU12(ThCoV HKU12) · 文鳥冠狀病毒HKU13英语Munia coronavirus HKU13(MuCoV HKU13) · 猪丁型冠状病毒(PdCV) · 繡眼冠狀病毒HKU16英语White-eye coronavirus HKU16(WeCoV HKU16) · 麻雀冠狀病毒HKU17(SpCoV HKU17) · 鵲鴝冠狀病毒HKU18(MRCoV HKU18) · 夜鷺冠狀病毒HKU19 · 鴨冠狀病毒HKU20(WiCoV HKU20) · 紅冠水雞冠狀病毒HKU21英语Common moorhen coronavirus HKU21(CMCoV HKU21) · 隼冠狀病毒HKU27(FalCoV UAE-HKU27) · 翎頜鴇冠狀病毒HKU28(HouCoV UAE-HKU28) · 鴿冠狀病毒HKU29(PiCoV UAE-HKU29) · 鵪鶉冠狀病毒HKU30(QuaCoV UAE-HKU30)