RTL9 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | RTL9, MAR9, MART9, RGAG1, retrotransposon gag domain containing 1, SIRH10, retrotransposon Gag like 9 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 300965 MGI: 2685231 HomoloGene: 104140 GeneCards: RTL9 |
---|
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. X: 110.36 – 110.46 Mb | Хр. X: 141.88 – 141.89 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RTL9 (англ. Retrotransposon Gag like 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі X-хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 388 амінокислот, а молекулярна маса — 144 280[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSIPLHSLRF | | NNTMREENVE | | PQNKQMAFCR | | PMTETRADVQ | | ILHSHVQLPI |
VSTSASDPGG | | TSTQLMTSPV | | FDTMSAPLMG | | VPNSGALSPP | | LMPASDSGAL |
SPLLMPASDS | | GALSPLLMPA | | LDSGTLSPLL | | STSEYGVMSP | | GMMTIPDFGT |
MSATLMVAPD | | SAEISPLAMP | | APSSGVVCTP | | IMSTSSSEAM | | STPLMLAPDS |
GELSPILMQD | | MNPGVMSTQP | | VPAPSSEAMS | | PLQITDEDTE | | AMSKVLMTAL |
ASGEISSLLM | | SGTDSEAISS | | LIMSAVASGG | | TSPQPTSTQN | | SGGIPTPLMS |
DLDSGIMSSL | | LMSSPGSEVM | | STPLLSVPDA | | GEMSTLPKPA | | PDAEAMSPAL |
MTALPSGVMP | | TQTMPAPGSG | | AMSPWSTQNV | | DSEMMSNPPV | | RATASGVMSA |
PPVRALDSGA | | MSTPLMGAPA | | SGNMSTLQKT | | VPASGAMTTS | | LMTVPSSGVM |
STEQMSATAS | | RVMSAQLTMA | | KTSGAMPTGS | | MKAVAKQYKR | | ATASGKMSTP |
LRRAPTSGAM | | STQPVTATAS | | ETMSMPQLTV | | PASGSMSMLQ | | MRAPVSEAMS |
MPQMRTMASG | | LTSAAQMKAM | | TSGAMSTPLM | | TAQTSGSTST | | LLMRDTASGV |
MSCPQMRSLA | | SGALSKPLMT | | PKASGTMFTE | | KMTTTASEAM | | PTLLMRDTVS |
GALSMPQMTD | | TASGGLSASL | | MRDTASGAMS | | TSQMTATVSG | | GMSMPLMRAQ |
DPGVMPASLM | | RAKVSGKMLS | | QPMSTQDPGG | | MSMSPMKSMT | | AGGMQMNSPT |
SDVMSTPTVR | | AWTSETMSTP | | LMRTSDPGER | | PSLLTRASSS | | GEMSLPLMRA |
PASGEIATPL | | RSPAYGAMSA | | PQMTATASGM | | MSSMPQVKAP | | ISGAMSMPLT |
RSTASGGMSM | | PLMRAPDSRV | | TSTSQMMPTA | | SGDMCTLPVR | | APASGGVSSP |
LVRAPASGTM | | STPLRRPSAC | | ETVSTELMRA | | SASGHMSTAQ | | TTAMVSGGMS |
KPLMRAPASG | | TMPMPLMSAM | | ASGEMSMPLM | | ETMASGATST | | LQTSVANSRS |
MSLSQTTYTV | | SGRMATAPIR | | ASASGARSTS | | FMRASVSGSM | | PMPLPRATAS |
GCGMGMSMPQ | | MTATDSRGMS | | TPLMRASGPG | | TMSTPQTAFG | | VMSTPEIKAT |
DSGEASTSHI | | NITASGSKPT | | SHMTATTPET | | AKPPPKEVPS | | FGMLTPALCY |
LLEEQEAARG | | SCSVEEEMEI | | DEEKQMKGFL | | DDSERMAFLV | | SLHLGAAERW |
FILQMEVGEP | | LSHENKSFLR | | RSQGIYDSLS | | EIDILSAVLC | | HPKQGQKSVR |
QYATDFLLLA | | RHLSWSDAIL | | RTRFLEGLSE | | AVTTKMGRIF | | LKVAGSLKEL |
IDRSLYTECQ | | LAEEKDSPGN | | SSQVLPTACK | | RNNEEAMGNE | | LSSQQQTEEH |
QHVSKRCYYL | | KEHGDPQEGL | | HDHLGQSTGH | | HQKAHTNK |
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Brandt J., Veith A.-M., Volff J.-N. (2005). A family of neofunctionalized Ty3/gypsy retrotransposon genes in mammalian genomes. Cytogenet. Genome Res. 110: 307—317. PMID 16093683 DOI:10.1159/000084963
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29245 (англ.) . Процитовано 22 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8NET4 (англ.) . Архів оригіналу за 8 листопада 2016. Процитовано 22 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |