MDK

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1MKC, 1MKN

Ідентифікатори

Символи

MDK, ARAP, MK, NEGF2, midkine (neurite growth-promoting factor 2), midkine

Зовнішні ІД

OMIM: 162096 MGI: 96949 HomoloGene: 1792 GeneCards: MDK

Онтологія гена
Молекулярна функція	• growth factor activity • heparin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • cell projection • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• Сигнальний шлях Notch • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • regulation of behavior • cerebellar granular layer development • dentate gyrus development • response to glucocorticoid • behavioral fear response • нейробіологія розвитку • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • дефекація • короткочасна пам'ять • cerebral cortex development • response to hormone • cell migration • hippocampus development • positive regulation of cell division • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of neuron death • response to wounding • adrenal gland development • диференціація клітин • regulation of signaling receptor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4192


17242

Ensembl


ENSG00000110492


ENSMUSG00000027239

UniProt


P21741


P12025

RefSeq (мРНК)

NM_001012333 NM_001012334 NM_001270550 NM_001270551 NM_001270552
NM_002391

NM_001012335 NM_001012336 NM_010784 NM_001291481 NM_001291482
NM_001291483

RefSeq (білок)

NP_001012333 NP_001012334 NP_001257479 NP_001257480 NP_001257481
NP_002382

NP_001012335 NP_001012336 NP_001278410 NP_001278411 NP_001278412
NP_034914

Локус (UCSC)

Хр. 11: 46.38 – 46.38 Mb

Хр. 2: 91.76 – 91.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MDK (англ. Midkine (neurite growth-promoting factor 2)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 143 амінокислот, а молекулярна маса — 15 585^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQHRGFLLLT	LLALLALTSA	VAKKKDKVKK	GGPGSECAEW	AWGPCTPSSK
DCGVGFREGT	CGAQTQRIRC	RVPCNWKKEF	GADCKYKFEN	WGACDGGTGT
KVRQGTLKKA	RYNAQCQETI	RVTKPCTPKT	KAKAKAKKGK	GKD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів росту, мітогенів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину. Секретований назовні.

Література

Tsutsui J., Uehara K., Kadomatsu K., Matsubara S., Muramatsu T. (1991). A new family of heparin-binding factors: strong conservation of midkine (MK) sequences between the human and the mouse. Biochem. Biophys. Res. Commun. 176: 792—797. PMID 2025291 DOI:10.1016/S0006-291X(05)80255-4
Fairhurst J.L., Kretschmer P.J., Gluzman Y., Boehlen P., Kovesdi I. (1993). Structure of the gene coding for the human retinoic acid-inducible factor, MK. DNA Cell Biol. 12: 139—147. PMID 8471163 DOI:10.1089/dna.1993.12.139
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
Uehara K., Matsubara S., Kadomatsu K., Tsutsui J., Muramatsu T. (1992). Genomic structure of human midkine (MK), a retinoic acid-responsive growth/differentiation factor. J. Biochem. 111: 563—567. PMID 1639750
Novotny W.F., Maffi T., Mehta R.L., Milner P.G. (1993). Identification of novel heparin-releasable proteins, as well as the cytokines midkine and pleiotrophin, in human postheparin plasma. Arterioscler. Thromb. 13: 1798—1805. PMID 8241100

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6972 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P21741 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.