CDH5

CDH5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2KOH

Ідентифікатори
Символи CDH5, 7B4, CD144, VE-cadherin, cadherin 5
Зовнішні ІД OMIM: 601120 MGI: 105057 HomoloGene: 1359 GeneCards: CDH5
Онтологія гена
Молекулярна функція

• calcium ion binding
• beta-catenin binding
• transmembrane transporter binding
• зв'язування з іоном металу
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• protein phosphatase binding
• signaling receptor binding
• cytoskeletal protein binding
• protein homodimerization activity
• cadherin binding
• vascular endothelial growth factor receptor 2 binding

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• мембрана
• cell-cell junction
• bicellular tight junction
• Адгезивні контакти
• cell surface
• міжклітинні контакти
• external side of plasma membrane
• cell periphery
• клітинна мембрана
• catenin complex

Біологічний процес

• positive regulation of establishment of endothelial barrier
• адгезія клітин
• cell-cell junction assembly
• adherens junction organization
• transforming growth factor beta receptor signaling pathway
• regulation of establishment of cell polarity
• negative regulation of cell population proliferation
• homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules
• blood vessel maturation
• cell-cell adhesion
• negative regulation of inflammatory response
• positive regulation of angiogenesis
• calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
• cell-cell adhesion mediated by cadherin
• GO:0000767 cell morphogenesis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1003
12562
Ensembl
ENSG00000179776
ENSMUSG00000031871
UniProt
P33151
P55284
RefSeq (мРНК)
NM_001114117
NM_001795
NM_009868
RefSeq (білок)
NP_001786
NP_033998
Локус (UCSC) Хр. 16: 66.37 – 66.4 Mb Хр. 8: 104.83 – 104.87 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CDH5 (англ. Cadherin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 784 амінокислот, а молекулярна маса — 87 528[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWI
WNQMHIDEEKNTSLPHHVGKIKSSVSRKNAKYLLKGEYVGKVFRVDAETG
DVFAIERLDRENISEYHLTAVIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPV
FTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADDPTVGDHASVMYQILKGKEYF
AIDNSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGDSGTATVLVTLQD
INDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRG
DYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMS
PPAGNRAQVIINITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQKKPLIGTVLAMDPDA
ARHSIGYSIRRTSDKGQFFRVTKKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKEL
DSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQPKVCENAVHGQLVLQI
SAIDKDITPRNVKFKFILNTENNFTLTDNHDNTANITVKYGQFDREHTKV
HFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFCEDMAAQVGVSIQA
VVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGG
GEMDTTSYDVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHG
GPGEMAAMIEVKKDEADHDGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDS
SDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDPREELLY

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

  • Shimoyama Y., Tsujimoto G., Kitajima M., Natori M. (2000). Identification of three human type-II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type-II classic cadherins. Biochem. J. 349: 159—167. PMID 10861224 DOI:10.1042/0264-6021:3490159
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Ali J., Liao F., Martens E., Muller W.A. (1997). Vascular endothelial cadherin (VE-cadherin): cloning and role in endothelial cell-cell adhesion. Microcirculation. 4: 267—277. PMID 9219219
  • Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1764 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, P33151 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350