Катепсин S

CTSS
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1GLO, 1MS6, 1NPZ, 1NQC, 2C0Y, 2F1G, 2FQ9, 2FRA, 2FRQ, 2FT2, 2FUD, 2FYE, 2G6D, 2G7Y, 2H7J, 2HH5, 2HHN, 2HXZ, 2OP3, 2R9M, 2R9N, 2R9O, 3IEJ, 3KWN, 3MPE, 3MPF, 3N3G, 3N4C, 3OVX, 4P6E, 4P6G

Ідентифікатори
Символи CTSS, cathepsin S
Зовнішні ІД OMIM: 116845 MGI: 107341 HomoloGene: 20867 GeneCards: CTSS
Реагує на сполуку
odanacatib[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• fibronectin binding
• cysteine-type peptidase activity
• collagen binding
• GO:0070122 peptidase activity
• cysteine-type endopeptidase activity
• laminin binding
• hydrolase activity
• proteoglycan binding
• serine-type endopeptidase activity

Клітинна компонента

• внутрішньоклітинна мембранна органела
• extracellular region
• endolysosome lumen
• lysosomal lumen
• лізосома
• міжклітинний простір
• tertiary granule lumen
• ficolin-1-rich granule lumen
• collagen-containing extracellular matrix
• late endosome

Біологічний процес

• positive regulation of cation channel activity
• antigen processing and presentation
• адаптивна імунна відповідь
• antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II
• protein processing
• extracellular matrix disassembly
• протеоліз
• toll-like receptor signaling pathway
• antigen processing and presentation of peptide antigen
• GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
• cellular response to thyroid hormone stimulus
• collagen catabolic process
• proteolysis involved in cellular protein catabolic process
• basement membrane disassembly
• response to acidic pH
• neutrophil degranulation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1520
13040
Ensembl
ENSG00000163131
ENSMUSG00000038642
UniProt
P25774
O70370
RefSeq (мРНК)
NM_004079
NM_001199739
NM_001267695
NM_021281
RefSeq (білок)
NP_001186668
NP_004070
NP_001254624
NP_067256
Локус (UCSC) Хр. 1: 150.73 – 150.77 Mb Хр. 3: 95.43 – 95.46 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Катепсін С (англ. Cathepsin S) — білок, який кодується геном CTSS, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 331 амінокислот, а молекулярна маса — 37 496[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKRLVCVLLVCSSAVAQLHKDPTLDHHWHLWKKTYGKQYKEKNEEAVRRL
IWEKNLKFVMLHNLEHSMGMHSYDLGMNHLGDMTSEEVMSLMSSLRVPSQ
WQRNITYKSNPNRILPDSVDWREKGCVTEVKYQGSCGACWAFSAVGALEA
QLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSTEKYGNKGCNGGFMTTAFQYIIDNKGIDS
DASYPYKAMDQKCQYDSKYRAATCSKYTELPYGREDVLKEAVANKGPVSV
GVDARHPSFFLYRSGVYYEPSCTQNVNHGVLVVGYGDLNGKEYWLVKNSW
GHNFGEEGYIRMARNKGNHCGIASFPSYPEI

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Локалізований у лізосомі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Fengler A., Brandt W. (1998). Three-dimensional structures of the cysteine proteases cathepsins K and S deduced by knowledge-based modelling and active site characteristics. Protein Eng. 11: 1007—1013. PMID 9876921 DOI:10.1093/protein/11.11.1007
  • Shi G.-P., Munger J.S., Meara J.P., Rich D.H., Chapman H.A. (1992). Molecular cloning and expression of human alveolar macrophage cathepsin S, an elastinolytic cysteine protease. J. Biol. Chem. 267: 7258—7262. PMID 1373132

Примітки

  1. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Cathepsin S переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2545 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
  5. ↑ UniProt, P25774 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»